제가 쓰는 방법인데요...
새리플이 달린 글의 리플숫자는 빨간색으로 표시가 됩니다. 일반 리플숫자는 검정색으로 나오구요.
물론 해당 부분을 수정하면 색상변경 되구요.
기본적인 시간은 하루기준이고...아래 소스에서 24를 48로 바꾸면 이틀이 됩니다.
제로보드/include 폴더에서 list_check.php 파일을 열어서...
60~70라인쯤에 보면...
$comment_num="[".$data[total_comment]."]"; // 간단한 답글 수
if($data[total_comment]==0) $comment_num="";
이런 부분이 있을겁니다. 저것을...

/* 새로운 코멘트 표시 */
$last_comment = mysql_fetch_array(mysql_query("select * from $t_comment"."_$id where parent='$data[no]' order by reg_date desc limit 1"));
$last_comment_time = $last_comment['reg_date'];
if(time()-$last_comment_time<60*60*24) $comment_num = "<img src='/bbs/images/board_comment.gif' align='middle'><font color=red>(".$data[total_comment].")</font>";
else $comment_num = "<img src='/bbs/images/board_comment.gif' align='middle'><font color=#000000>(".$data[total_comment].")</font>";
/* 새로운 코멘트 끝 */

처럼 바꿔주면 됩니다.

리플? 코멘트를 말하는건다요?
새글은 기준이 있어야 합니다. 오늘, 혹은 24시간유지하는것이지?
스킨에만 적용할수 있고 전체게시판에 적용할수도 있어요.