플래시 MX를 쓰시는지 5를 쓰시는지 잘 모르겠는데요.
사운드의 속성을 정해줄수 있는 곳이 있습니다.
mx의 경우는 음악이 있는 프레임을 선택하고 아래있는 property부분에서 설정할수가 있구요.
플래시 5에서는 sound패널에 있었던것 같습니다.
그럼 event,stream,start등등을 선택할수 있는데요,
이중에서 stream을 선택하시면 무비진행과 사운드의 진행이 동시에 이루어지게 됩니다.
하지만 이것도 단점이 무비재생속도가 느려지면 사운드역시 같이 느려질수 밖에 없겠죠.
좀 심할경우 이상하게 들릴수도 있구요.

덧붙이자면 이와 반대로 event는 무비진행과 상관없이 그냥 한번딱 사운드가 실행되서 끝납니다.

액션으로 1프레임과 5프레임을 왔다갔다 하게 해줬다면
stream의 경우 같은 부분이 프레임흐름에 따라 반복됩니다.
하지만 event의 경우는 무비가 어떻게 되든 상관없이 한번 실행되면 꿋꿋이 끝까지 재생되죠..

참고가 됐길..

재생모드와 음질은 상관이 없습니다.
아마 퍼블리시 세팅에서 stream의 음질이 안좋게 되어있을꺼에요..
무비랑 마찬가지로 음악이 너무 용량이 높아서 버벅대도 무비자체가 느려지게 될수 있으니깐요. 아님 순간이동을 한다던가...
압축방식을 mp3로 하시고 64kb정도면 집중해서 듣지 않는다면 그렇게 음질이 나빠지는건 느껴지지않고요.
조금 더 높여주셔도 큰 무리는 없을거에요..
음질을 바꿔보시면서 테스트를해보세요..