동영상 옆에 빈공간에 위젯을 넣으려고 하는 것이 아닙니까?
그렇게 되면 총 3단이 되겠죠.(로그인, 동영상, 다른 위젯)

예로 동영상 우측에 실시간 게시물위젯이 올라갔으면 좋겠다.....

레이아웃 잘 못 된 것이 아닙니다.
페이지를 잘 짜면 됩니다.
3단 그 이상도 넣을 수 있습니다.
4단의 예)
http://hihsw.com/?mid=hpsdata

별 다른 방법이 있는 것이 아닙니다.
위젯크기 조절, 박스 이용을 잘해서 만들면 됩니다.

그건 홈페이지 가로사이즈응 어느 정도 할 것인지 홈페이지 주인이 결정할 문제이지만 모니터해상도가 통상 1024를 많이 사용하지만 640 을 사용하는 사람도 있을 수 있다는 것입니다.

1240로 만든 홈페이지는 많지 않기 때문에 레이아웃을 다시 만들어야 합니다.
해상도가 작은 방문자는 가로 스크롤이 생기겠지만...

웹의 숙지 정도가 어느 정도인지도 모르거니와 오늘 가입하여서 zbxe를 접하는 것 같은데 메뉴얼과 배포된 버전을 비교하면서 공부해야 합니다.
다름 사람이 배포한 것을 사용하는 수준이 아니고 자기의 취향대로 만들기를 원하면 css, php 등등 을 익히십시오.
레이아웃 만들고 나면 또 다음 문제가 계속 발생 할 것입니다.