밑에 소스를 utf-8형식으로 del.php 로 저장을 하시고~~
ftp로 업로드를 합니다.(저는 xe 설치된 인덱스 파일 있는 곳에 업로드 하였습니다.)
그리고 홈페이지/del.php (방금 업로드한 경로) 로 치시고 들어가면 , 삭제성공이라는 메세지만 달랑 보이구요,..
그러고 난 다음~ files를 삭제해보면 삭제가 됩니다..
ps. 처음 삭제를 하면 안에 파일만 삭제가 되는데요.. 삭제성공하고 난 다음~ 폴더하나하나를 삭제 하시면 됩니다.
      그럼 좋게 사용하십시요.. 
 
  출처 : 네이버 지식인(저도 예전에 복사떠둔 것이라서 정확히는 잘 모르겟습니다.)

<?
$dir="절대경로/삭제할파일"; // 순환적으로 디렉토리와 파일을 삭제(예를들면 절대경로/files)
function delete_dir($path) {
  @chmod($path,0777);//삭제하려는 폴더의 퍼미션을 777로 재 지정
  $directory = dir($path);
  while($entry = $directory->read()) {
    if ($entry != "." && $entry != "..") {
      if (is_dir($path."/".$entry)) { //삭제하려는 폴더안에 서브 폴더가 있을경우 재루프
        delete_dir($path."/".$entry);
      } else {
        @chmod($path."/".$entry,0777);//삭제하려는 폴더안에 파일일 경우 파일 퍼미션을 777로 재지정
        @UnLink ($path."/".$entry);
      }
    }
  }
  $directory->close();     
}

delete_dir($dir);
echo"삭제완료";
?>