참고로
간단하게 예를 들자면

댓글 갯수에 링크를
<a href="#" onClick="javascript:window.open('http://localhost/xe/test.php?val={$document->document_srl}','pop','width=300, height=300')">
이렇게 걸었다면

링크의 경로...즉 localhost/xe 속에 test.php 파일이 존재 해야겠죠......

그리고 그 파일 속에

<?php
 $val = filter_input(INPUT_GET, "val");

 $con = mysql_connect("localhost", "root", "0000") || die(mysql_error());
 $con_db = mysql_select_db("xe") || die(mysql_error());
 $sql = "select * from xe_comments where document_srl=".$val;
 $result = mysql_query($sql);

 echo "<table>";
 while( $row = mysql_fetch_assoc($result) )
 {
  echo "<tr><td>".$row[content]."</td></tr>";
 }
echo "</table>";
?>
붉은 글씨(윗줄)는 DB접속에 맞게 수정(host, user, pass)
아랫쪽 xe 는 DB명으로 수정
이렇게 삽입해서 게시판 목록에서 댓글갯수를 클릭하면
팝업창이 뜨면서 댓글들만 보일겁니다.....

나머지는 입맛에 맞게 추가하거나 해서 꾸미면 될 것 같습니다.....