답변 주셔서 감사합니다. 그런데 아무래도 이건 다른 문제가 아닌가 싶습니다. 한 3일동안 몇번을 덮었다 지웠다 했는지 모르겠습니다. 마지막으로 정말 전부다 지웠습니다. db도 지우고 새로 생성했구요. ftp도 완전히 지우고 xe도 새버전으로 다시 다운받아서 올리고 인스톨했습니다. 아예 데이타는 복구 하지도 않았구요. 완전히 새로 홈페이지를 만들려고 한거죠. 그런데도 메뉴생성이 안됩니다. 이해를 돕기 위해 캡쳐 한것 보여드릴께요. 바쁘시겠지만 한번만 봐주세요. 

이렇게 add menu에 파란색 테두리만 생길 뿐 동작을 안합니다. 

이것역시 버튼이 전혀 동작하지 않습니다. 아예 기본으로 되어 있는 official 레이아웃도 안 뜹니다. 

완전히 지우고 새로 깐 후 admin 페이지에서 설정이나 고급을 누르면 첫 페이지로 가버립니다. 

이게 아무것도 안 건드리고 완전히 깨끗하게 지운 서버에 그저 설치만 한 상태에서 생기는 문제입니다. 

아직 안 지운 상태에서 완전히 복구했을 때는 그래도 설정이나 고급에 들어갈 수 있었습니다. 

그런데 조금 이상한게 어떤 버튼은 보이지 않고 동작도 안한다는 겁니다.  아래 보시면 homepage 가 번호로 나오죠? 보통은 url로 나오잖아요. 그리고 그 옆에 원래 "찾기"버튼이 있어야 하는데 없습니다. 

또 아래 보시면 advance  옆에 화살표가 나와서 숨겨진 advance 설정에 들어갈 수 있어야 하는데 안나옵니다. 그래서 advance 설정에는 아예 들어갈 수 없게 되어 있었어요. 그게 복구된 상태에서 생기는 문제입니다. 위에 메뉴랑 레이아웃 안 생기는 것은 마찬가지구요. 

혹시 어떤 문제인지 아실 수 있나요? 이건 뭐 아예 다시 깔려고 해도 안되니 난감하네요. 다시 말씀 드리지만 같은 godaddy 어카운트에 있는 다른 서버에서는 모든 게 정상적으로 깔리고 제대로 홈페이지를 만들었었습니다. xe 로 두어번 홈페이지 만들어 보고 재미붙여서 아는 분이 봉사하시는 단체 홈페이지가 wp로 되어 있길래 xe로 만들면 훨씬 다양하게 여러가지 페이지를 만들 수 있고 게시판도 여러개 만들수 있다고 큰소리 쳐놓고 시작했는데 난감하게 되었습니다. 대표 도메인을 꼭 사용해야 하고 이 문제가 있는 서버를 2020년까지 계약해 놓으셔서 바꿀수가 없는 상황입니다. 제발 도와주세요....ㅜㅜ

혼마님의 도움으로 해결하였습니다. 제 경우는 압축 파일을 풀지 않고 올린 후 ftp 상에서 압축을 해제하니 해결되었습니다. 동일하게 이전을 할 때도 파일을 모두 압축 상태로 올려서 ftp 상에서 압축을 푸니 문제없이 이전이 되었습니다. godaddy 에서는 putty 에서 압축을 하니 압축된 파일이 root 에 저장되는데 저장된 파일이 putty 에서 확인하면 나타나는데 filezilla 에서는 root 까지는 나타나지 않아서 좀 헤맸는데 godaddy에 문의하니 godaddy에서 제공하는 파일관리 프로그램을 사용하면 된다고 해서 그걸로 해결이 되었습니다. 너무 늦게 댓글에 답을 드려서 이미 해결하셨을지 모르지만 만약 아직 해결 안되신 거면 도움이 되길 바랍니다.