이게 진짜 되나요?

네 됩니다. :D

회원가입 페이지처럼 공통으로 사용하는 부분까지 커스터마이징하려면 간단한 방법은 없고요... 사용하실 레이아웃을 모두 합친 후, 조건문을 넣어서 구현이 가능합니다.

예를 들어 4개의 레이아웃을 사용하고 싶다면 각각의 layout.html을 복사해서 layoutA.html, layoutB.html 등으로 저장하고, 각 레이아웃에서 인클루드하는 다른 파일들과 사용하는 CSS, JS, 이미지 파일들도 서로 경로가 충돌하지 않는 한도 내에서 한 군데에 모두 합친 후... (만약 충돌한다면 이름을 바꾸고, 관련 소스도 수정해 주어야 합니다.)

합친 레이아웃의 메인 파일(layout.html)에서

if ($_SERVER['HTTP_HOST'] == 'www.A.com') {
    // layoutA.html 인클루드
} elseif ($_SERVER['HTTP_HOST'] == 'www.B.com') {
    // layoutB.html 인클루드
} elseif ($_SERVER['HTTP_HOST'] == 'www.C.com') {
    // layoutC.html 인클루드
} else {
    // layoutD.html 인클루드
}

이런 식으로 조건문을 사용하여 원하는 레이아웃을 인클루드하면 됩니다.