좌측 아랫부분 카운터쪽에 배너를 넣어 게시판을 연결시키신다는 말씀인가요? 홈페이지 레이아웃이라면 좌측부분이 되겠군요.
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  <div id="columnLeft">
위처럼 cloumnleft 부분부터가 좌측 부분 레이어에 해당됩니다.
그리고
<!-- 카운터 -->
            <img width="100%" height="100" src="http://akirahoony.mireene.com/zbxe/common/tpl/images/widget_bg.jpg" class="zbxe_widget_output" style="clear:both;" widget="counter_status" body="" skin="default" colorset="normal" widget_cache="0" widget_sequence="2057" />

위 부분이 카운터위젯에 해당되네요. 위 부분의 바로 위에 불러올 배너 이미지를 <img src=이미지경로>이미지 태그를 써서 불러온다면 (물론 배너가 좌측사이즈보단 작아야 할듯 하네요) 카운터 위에 나타날것이고, 아래에 넣어준다면 아래에 나타날것입니다. 그리고 그 이미지에 <a href ="게시판주소"><img src=이미지경로 border=0></a>처럼 게시판을 링크를 걸어놓으시면 됩니다.

여기서 게시판은 지금 쓰시고 있는 레이아웃이 적용되어 있어야 적용된 레이아웃도 같이 나타납니다. 게시판 모듈에서 게시판목록에서 사용할 게시판보기를 누르시면 주소창에 게시판 주소가 뜹니다 그걸 넣어주시거나. 홈주소/zbxe/게시판명 이걸 넣어주시면 될듯 합니다.

그런데 메인창이라 함은 혹시 프레임이 나누어져 있으신가요? 그렇다면 제가 횡설수설을.. ㅡ ㅡ;;

그리고 제로보드xe메뉴얼 들어가시면 똑띠님의 홈페이지 만들기 읽어보시면 도움이 많이 되실겁니다~
http://www.zeroboard.com/?mid=manual&pageid=394430