삭제하시고 싶은 부분이 검색하는 부분 전체가 아니라 검색 옵션(제목, 제목+본문,댓글 등) 선택하는 부분이라는 말씀이신가요?

그런 경우 사용하시는 레이아웃의 layout.html 파일을 에디터에서 여셔서 검색 폼 출력 부분을 아래와 같이 수정하시면 됩니다.

        <form action="{getUrl()}" method="post" id="isSearch">
            <!--@if($vid)-->
            <input type="hidden" name="vid" value="{$vid}" />
            <!--@end-->
            <input type="hidden" name="mid" value="{$mid}" />
            <input type="hidden" name="act" value="IS" />
            <input type="hidden" name="search_target" value="title_content" />
            <input name="is_keyword" type="text" class="inputText" title="keyword" />

            <input type="image" src="./images/{$layout_info->colorset}/buttonSearch.gif" alt="{$lang->cmd_search}" class="submit" />
        </form>

현재 배포된 공식 레이아웃은 이렇게 되어 있는데, 사용하시는 레이아웃이 아마 예전 버전 방식의 레이아웃을 사용하시나 봅니다. ^^*
초기 배포본에는 저런 옵션이 선택 가능하게 만들어져서 배포되었었거든요.. 하하!
최근에는 저 옵션 선택 부분을 제거한 채로 배포되는...
문제가 있어서가 아니라, 옵션의 활용이 너무 적어서 그렇겠죠? ^^*