아쉽게도 만들어져있거나 배포되는 자료는 없네요.  그렇다고 한두줄 추가로 만들건 또 아니고요

관리자페이지 -> 컨텐츠-> 댓글  에서  게시글 기반 검색기능을 지원하면 그나마 좀 간단할 수도 있는데
아쉽게도 지원을 안 하네요.   comment 모듈을 조금만  이래저래 건들면 해당 페이지에
문서번호 기반의 검색 기능을 만드실 수 있을거예요.  그러면 문서번로 검색 후 삭제가 가능하겠죠 
( 단 댓글이 30개씩 지워지겠지만 ㅡㅡ;  개수를 늘릴 수도 있긴하지만 )

아니면 아예 게시글 자체에 해당 글의 모든 댓글을 삭제하는 함수를 하나 새로 추가하는 방법도 있겠죠
게시판 전체에 대해 게시글은 보존하고 모든 댓글을 다 삭제하고 조회수/추천수 등을 다 초기화하는 기능을 만든적이 있는데
(  http://sejin7940.co.kr/index.php?mid=sejin7940_work&category=90459&document_srl=107470 )
이런 형태로 해서,  게시글의 모든 댓글을 삭제하는 기능도 만들 수가 있겠죠.  (Xe내부의 삭제함수를 쓰면 포인트 차감등도 다 가능하겠죠)

직접 만드시기 어려우면 제작의뢰로 제작자를 찾으시거나 하면 개발가능하신 분들이 있을거예요